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经过各部门共同努力，新疆棉花育种创新能力不断提升。截至目前，棉花主栽品种以本地自育品种为主导，占90%以上。新疆已成为全国最大的棉花制种基地，棉花种子加工水平达到国际领先水平。

近年来，新疆种业企业与科研院所联手，从棉花种质资源收集、联合培育新品种到共同打造育种创新平台，集中优势力量攻克品种选育中的关键“卡脖子”难题，不断提高新疆棉花品种选育能力。

2023年2月，国家棉花生物育种产业科技创新联盟揭牌成立，该创新联盟旨在整合全国范围内的优势科研院所、种业和棉花龙头企业等棉花全产业链资源，以产业需求为导向，借助基因工程和全基因组设计育种等关键技术开展精准育种，促进我国棉花产业科技创新。

“生物育种可以推动经验育种向智能设计育种转变，有效缩短育种周期，使育种技术向精准化、智能化发展。”李雪源说，“但如何确保导入的优异基因能够保持性状稳定仍是我们要关注的重点和难点。”

李雪源介绍，新疆具备棉花大面积单产提升的热量、光照等基础优势，规模化、机械化、标准化、智能化的生产方式也为大面积单产提升提供了生产保障，棉花大面积单产提升要重点通过增加亩成铃数和铃重来实现，这是育种专家们选育新品种的主要目标。

一直以来，新疆棉花育种目标主要是早熟、高产稳产、抗病、抗虫、优质。随着机械化水平不断提升，育种专家们开始积极培育适宜机采的品种，未来还需选育棉油饲兼用品种。

世界棉花看中国，中国棉花看新疆。新疆棉花总产量连续5年稳定在500万吨以上，种植面积、总产量连续30年位居中国第一。

植物的抗逆性是指植物具有的抵抗低温冷害、高温、干旱、盐碱、病虫草害等不利环境的特性。研究表明，植物的优良抗逆性状，在自然条件下很难转移到其他种类植物体内，需借助基因工程改良等生物育种技术将优良基因导入其他作物中，进而提升抗逆性。

截至目前，新疆金丰源种业有限公司不仅牵头组建了新疆“新丝路”转基因抗虫棉试验联合体，同时和科研单位联合组建了国家棉花生物育种产业科技创新联盟、棉花生物育种联合研究中心、浙阿棉花生物育种创新中心3个棉花育种创新平台，旨在促进科研成果顺利转化，培养一批素质高、能力强、专业化的本地棉花科研工作者，提升当地棉花育种竞争力。

不仅如此，为破解棉花育种面临的关键技术难题，新疆启动了一批棉花育种领域重大科研项目。如“棉花品种重大农艺性状解析与分子设计育种”。该项目首次以科研单位作为发榜方，面向全国科研单位发榜，组织优势团队开展联合攻关，围绕源棉8号等品种，解析品种重要农艺性状，开展品种改良，提高品种的衣分和抗逆性，为新疆棉花产业稳产保供、提质增效、绿色可持续发展提供技术支撑。

新濠博亚官方网站“品种对棉花高产贡献率超过35%，对品质提升更具有决定性作用。”新疆棉花产业技术体系首席专家、新疆农业科学院经济作物研究所研究员李雪源说。

以新疆金丰源种业有限公司为例，该公司是一家集农作物种子育、繁、推于一体的农业产业化龙头企业。“随着国储棉政策的调整，纺织厂对高品质原棉的需求更加迫切。因此，培育出更高品质的棉花品种也是育种企业不懈的追求。”该公司研发中心副主任刘军介绍，公司和自治区农业科学院合作10余年，联合培育出3个棉花新品种，推广面积超过300万亩。

“新疆棉花种植区域广阔，环境复杂多样，培育符合新疆气候资源特点的优质棉花品种，对棉花产业高质量发展至关重要。”自治区棉花协会秘书长苏旭红说，“我们通过公正科学筛选比对，提出推荐意见，推荐相同生态区域种植一个主栽品种、两个辅助品种，即‘一主两辅’棉花品种，旨在更好解决我区棉花品种多乱杂现象，提高原棉品质一致性，提升我区棉花质量。”

近30年来，李雪源带领团队培育出20余个多功能棉花品种，很多品种填补了新疆棉花品种空白，其中新陆中78、源棉8号已成为当地主导品种。

产量连年提升，但也面临新的问题。一段时间，棉花重产量轻品质，产量及品质难以协同提高，植棉成本高、效益下滑，严重影响了新疆棉花产业的发展。

针对这些问题，李雪源带领团队选育出突破性棉花品种源棉8号，该品种综合性能优，集早熟、高产、抗病、优质、机采等优良性状于一体，在新疆棉花产业技术体系“百千万”高产示范田创建中实现棉花量质协同提高全国纪录。

科研单位、企业共同发力，相关部门也积极引导。2022年，由自治区棉花协会牵头，新疆首次面向全区11个植棉地(州、市)、38个植棉县(市)、45个生态区，推荐品质与产量兼顾且符合当地棉农种植意愿的棉花主栽品种35个，其中北疆15个、东疆4个、南疆16个。