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她长期从事新发传染病病原学研究，主要开展蝙蝠等野生动物新病毒发现与鉴定、生物学特征、病毒跨种感染机理和传播规律等研究，在蝙蝠冠状病毒的分布和遗传进化、SARS病毒溯源、新冠肺炎病原鉴定和溯源等方面取得突破性成果。

石正丽先后在Nature、Science、Cell等国内外学术期刊发表论文被引逾31000余次，通讯作者单篇最高引用次数1.2万余次；曾获湖北省自然科学奖一等奖（2017年，第一完成人）和二等奖（2003年，第一完成人）、国家自然科学奖二等奖（2018年，第一完成人）、上海市科技进步奖一等奖（2020年，第二完成人）；获全国“五一”劳动奖章、中国科学院“优秀研究生导师” 和“先进工作者”等荣誉， 2019年当选为美国微生物科学院fellow。

广州实验室于2021年5月正式成立，科研和临床园区分别坐落于广州国际生物岛和大坦沙岛，是呼吸系统疾病及其防控领域的新型科研事业单位。目前，共和国勋章获得者、中国工程院院士钟南山担任广州实验室主任。

广州实验室官网公布的简历信息显示，自1990年7月起，石正丽长期在中国科学院武汉病毒研究所工作，先后担任研究实习员、助理研究员、副研究员，于2000年10月起任研究员。2024年5月，她转赴广州实验室担任研究员。

石正丽1987年获武汉大学遗传专业学士学位，1990年获中国科学院武汉病毒所病毒学硕士学位，2000年获法国蒙彼利埃第二大学（Montpellier University II）病毒学博士学位。

今年7月，科学网曾发布广州实验室石正丽课题组公开招聘启事，公开招募2-3名博士后。该启事介绍称，石正丽课题组主要开展新发传染病病原鉴定、溯源和分子流行病学研究，动物源新发病毒跨种感染和传播风险预警研究，呼吸道病毒感染引起重症肺炎的分子机制研究等方向。

乐鱼登录网址10月31日，武汉大学官网发布了一则“严欢团队Nature发文首次提出人工设计病毒受体”的消息。其中，该消息披露了论文共同通讯作者石正丽的任职单位为广州实验室、中国科学院武汉病毒研究所。