由于人工繁殖朱鹮的计划失败，到1995年，日本只剩下了垂垂老矣的雌性朱鹮“阿金”。2003年，随着“阿金”的离世，已知的日本朱鹮全部死亡。

日本环境省2019年宣布，由于人工繁殖朱鹮及其野生放飞取得成功，下调朱鹮在日本濒危物种红色名录中的级别，从第二个级别的“野生灭绝”下调至第三个级别的“濒临灭绝1A类”，标志着朱鹮在日本摆脱了灭绝的危机。

1999年1月，作为中国赠送给日本的礼物，朱鹮“洋洋”和“友友”在日本朱鹮即将灭绝之际来到佐渡，拯救了日本的朱鹮族群。

日本环境省称，截至2023年底，日本国内推定有532只野生朱鹮栖息。截至2024年7月底，东京、新潟、石川和岛根的设施内共有饲养的朱鹮175只。

朱鹮被誉为“东方宝石”“吉祥之鸟”，是全球濒危的鸟类之一，曾广泛分布在中日韩等东亚地区。进入20世纪，野生朱鹮在朝鲜半岛、日本等地相继绝迹。

经过多年持续保护，截至2023年11月，全球朱鹮种群数量超过1万只。曾经濒临灭绝的“东方宝石”，从秦岭腹心飞向世界多地，成为全球鸟类保护的成功典范，而朱鹮所述说着的关于生命、绿色与友谊的传奇，也将一直延续。

幸运的是，朱鹮并没有完全灭绝。1981年，就在日本捕获最后的野生朱鹮同年，中国鸟类专家在陕西省秦岭腹地发现7只野生朱鹮，给这一物种的留存和复兴带来一线希望。

这是2016年以来，时隔8年再次进行朱鹮归还活动。根据中日双方的备忘录，日方需要从中国提供的朱鹮所繁育的后代中，归还一半给中国。

sina新浪首页体育中新网10月29日电 “这将是时隔8年，日本再次把朱鹮归还中国”。据日本共同社报道，当地时间10月29日，日本环境省和中国有关方面在日本佐渡市进行了交接签署仪式，日本确认将16只朱鹮归还中国。

资料显示，明治维新后，日本朱鹮生存环境日益恶化，加上人工捕猎，曾遍布日本各地的朱鹮数量逐年减少。1981年，为抢救朱鹮，日本将佐渡仅存的5只野生朱鹮捕获，送至佐渡保护中心进行人工饲养。