他于1982年至1992年在河北人民出版社工作，历任编辑，编辑室副主任、主任，副社长；1992年10月至2004年任河北教育出版社社长、总编辑、党委书记；2004年1月任河北出版集团党委委员、管委会副主任，河北出版总社副社长；2006年8月任故宫博物院紫禁城出版社社长；2007年4月由文化部任命为故宫博物院副院长，兼紫禁城出版社社长；2014年1月被文化部任命为故宫博物院常务副院长。至迟于2019年，王亚民卸任故宫博物院常务副院长。

他曾策划编辑了《李大钊全集》《中国现代学术经典》《二十世纪文学名著》《新莎士比亚全集》《梅兰芳藏戏曲史料图画集》等图书，并发表多部学术著作。

万博manbetx11月15日，中央纪委国家监委网站援引中央纪委国家监委驻文化和旅游部纪检监察组、辽宁省监委消息通报称：故宫博物院原常务副院长王亚民涉嫌严重违纪违法，目前正接受中央纪委国家监委驻文化和旅游部纪检监察组纪律审查和辽宁省铁岭市监委监察调查。