当地时间6月3日，位于巴伐利亚州的雷根斯堡以及其他十个地区发布洪水警报，宣布进入灾难状态。巴伐利亚州环境署报告称，多瑙河当天早上的水位已比正常水平高出5.9米。虽然各支流的洪水正逐渐消退，但多瑙河本身的洪灾风险越来越大。环境署预计，短期内还无法解除警报，雷根斯堡以及周边的施特劳宾、帕绍等地都需为多瑙河的高水位做好预防工作。

迪拜皇宫游戏由于连日持续降雨，德国西南部多瑙河、内卡河等多条河流水位上涨，导致当地数座城市遭遇洪水侵袭，迫使数千人撤离。其中巴伐利亚州和巴登-符腾堡州受灾最为严重。在刚刚过去的周末，巴登-符腾堡州和巴伐利亚州的部分地区24小时内每平方米降雨量超过100升，有些城镇甚至达到近一百年来最高水位。

德国总理朔尔茨3日前往灾区，并将和内政与国土部长南希·费泽、巴伐利亚州州长马库斯·索德尔会面。出自绿党的德国副总理兼经济和气候保护部长罗伯特·哈贝克2日视察灾区，承诺提供援助。他告诉德国新闻电视频道：“自然灾害一直伴随着人类。我们正看到极端天气频繁出现。每隔几年就会出现创纪录洪水……还有创纪录降雨。”

截至当地时间2日凌晨2时，德国气象局向南部14个地区发布最高级别的恶劣天气警报，并预测接下来24小时内南部多地将有更多暴雨。有关部门表示，尽管各市政当局先前有数天时间做防洪准备，但由于德国南部多地交通被洪水切断，仍有约3000名民众不得不撤离。