耿云志用力最多、成绩最显著、影响最大的是他对近代思想史的研究，特别是对胡适的研究。从1975年开始，他从深入研究材料入手，对胡适展开全面研究，并于1979年5月发表第一篇论文《胡适与五四时期的新文化运动》。此文首次对胡适作出实事求是的新评价，指出胡适与陈独秀一起，是新文化运动的领袖，产生了很大影响。

另外，他发表论文和文章数百篇，其中影响较大的有《胡适与五四时期的新文化运动》《论清末立宪派的国会请愿运动》《孙中山与梁启超——中国现代化的选择》《五四新文化运动再认识》《中国新文化的源流及其趋向》等。

耿云志主要著作包括《胡适研究论稿》《胡适年谱》《胡适新论》《蓼草集》《蓼草续集》《耿云志文集》《近代中国文化转型研究导论》等，合著有《中华民国史》第一卷（上、下）《梁启超》《西方民主在近代中国》等。

qy千亿平台8月2日，澎湃新闻（www.thepaper.cn）从相关部门获悉，中国共产党党员、著名历史学家、中国社会科学院学部委员、中国社会科学院近代史研究所原副所长、研究员、享受国务院政府特殊津贴专家、退休干部耿云志同志，因病医治无效，于2024年8月2日在北京逝世，享年85岁。

公开资料显示，耿云志1938年12月生于辽宁海城县，1964年于辽宁大学哲学系毕业后，即进入中国科学院哲学社会科学部（中国社会科学院前身）近代史研究所工作，长期从事中国近代政治史、思想史和文化史的研究，尤以思想史研究为主。