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  • 更新时间:2024-12-12T14:13:51
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下一代测序技术的成熟推动了全球基因组学的挖掘与共享进程,在既往的组学研究中,研究人员通常按物种或采样地点进行混样,从而初步解析病毒多样性。然而,传统的混合样本测序无法清晰揭示个体之间或生态系统中不同组成部分之间的关系,还存在样本主要集中于粪便、难以区分环境污染等问题。此外,低丰度病毒面临基因组碎片化、片段化的挑战,混合样本难以实现病毒片段的精准分类,大大制约了病毒基因组的获取。

澎湃新闻(www.thepaper.cn)记者从复旦大学方面获悉,复旦大学公共卫生学院粟硕教授团队与合作者运用前沿交叉研究方法,揭示多种哺乳动物宏基因组数据中的病毒基因组组成、生态学特征与跨物种传播规律。在“同一健康”理念下,为构建人-动物-环境一体化多维度新发传染病预测预警体系奠定重要数据基础。

研究团队的跨学科交叉研究方法,为其他新发病原体的风险评估树立了范例,为构建多维度新发传染病风险评估体系奠定了基础。这不仅对公共卫生领域产生深远影响,同时也为病毒学、生态学等相关领域提供了新的研究视角和方法指引。

随着全球城市化进程加速,密集的城郊人口、集约化养殖、便捷旅行及环境变化等社会生态因素促使新发传染病频发。这些传染病常由动物引发,并在人畜密切接触、一些卫生条件不佳的地区显现,公共卫生防线前置需求迫在眉睫。

尽管先前大量碎片化的研究提示部分养殖哺乳动物具有携带人兽共患病毒的潜力,但哺乳动物种类多样,除传统家畜外,缺乏对其他养殖哺乳动物多地域、多类群、跨物种等不同维度内的综合病毒组挖掘与跨尺度信息整合研究。当前这些动物的病原生态学与流行病学数据存在较大空白,制约了新发传染病疫情的精准防控。

近年来,复旦大学粟硕团队致力于应用多学科交叉技术进行新发病毒综合防控研究。此前团队已经在《细胞》(Cell)杂志发表多篇论文,揭示了哪些动物携带和可能传播风险病原,讨论了针对公共卫生防控在未来可采用的宏基因组和多种交叉研究全新监测方法。2024年8月,团队应邀在Cell上发表对全球高致病性禽流感A(H5N1)疫情防控的观点。文章针对H5N1在美国奶牛场暴发且出现突变病毒(PB2-E627K)外溢到四名奶牛场工人的案例,强调了养殖动物是除禽类以外的人类感染的潜在前线,提出了在环境-动物-人类界面上跨学科研究、全景监测防控禽流感病毒的前沿观点。

“现阶段潜在风险病原体并没有公共卫生风险,但对于那些在动物中已经表现出较高流行趋势的病原体,应当加强其在动物中的监测和防控。”粟硕表示,盖塔病毒已在我国多种养殖和野生动物中被监测到,具有频繁跨物种传播能力,应加强对盖塔病毒的监测并尽早储备动物疫苗,保障动物健康养殖以及预防其潜在跨物种传播风险。

“我们的研究希望填补当前对动物携带微生物的认知空白,尤其是养殖哺乳动物。”粟硕表示,大多数人类病毒都源自动物传播,但究竟哪些动物携带何种病毒、这些病毒未来是否会对人类构成潜在威胁,目前仍存在较大不确定性,“如果能提前监测和预报这些病毒,并部署包括疫苗研发在内的综合防控措施,这对于新发传染病关口前移、保障人类健康至关重要。”

在将近三年的研究过程中,团队面临的最大挑战在于海量宏基因组数据的处理与分析。“分析这些数据需要过硬的生物信息学能力。我们要从海量的原始数据中筛选出病毒信号,并确定哪些是真正的病毒序列。”粟硕带领团队构建高效的一体化宏病毒组注释管道,用于数据清洗、病毒识别和生物信息学分析,成功攻克这一难题。

“我们采用的新方法可以精确地在个体层面解析病毒共感染状况,并能更灵敏地检测低丰度病毒,揭示出动物组织器官、个体乃至群体间的多层次病原分布情况,从而获得更为丰富和高分辨率的数据。”粟硕介绍。这意味着研究人员能获得更加细致的分析结果、进行更深入的统计学分析,从而揭示不同尺度上的病原生态学问题。

针对这些局限,团队设计了单组织单样本的建库策略,实现了在个体水平解析病毒共感染以及更灵敏的挖掘低丰度病毒。研究在166个单组织文库里鉴定到2种以上的病毒,发现星状病毒、细小病毒等与其他病毒频繁发生共感染。通过对低丰度病毒片段的精准拼接,避免了真阳性病毒因丰度阈值而被过滤,实现了多个病毒的90%基因组完成度。

优客网官网登录入口近年来,伪狂犬、猴痘等病毒从动物向人类外溢,引发新发传染病甚至全球大流行的频率正在显著增加。如何精准预测和预报动物源新发传染病是关系绿色健康养殖与公共卫生防控的重要科学问题。

北京时间9月4日,粟硕教授团队研究成果以题为“Farmed fur animals harbor viruseswith zoonotic spillover potential”的研究长文在《自然》(Nature)发表。

论文的前三位共同第一作者均是课题组在读研究生。下一步,团队将继续聚焦于人和动物新发病毒的预测预报和综合防控研究,将病毒宏基因组等新技术与传统的流行病学数据、环境和生态因素相结合,并针对研究瓶颈按需求开发新的生物信息分析方法,力争为传染病防控和公共卫生安全提供更有力的科学支撑。

研究获得的病毒数据,丰富了哺乳动物的病毒本底数据,通过揭示养殖哺乳动物体内病毒的复杂组成,探索病毒跨物种传播的潜力,该研究强调了将公共卫生安全防线前移的重要性。

团队对来自5个动物目的哺乳动物进行了系统的宏基因组研究,鉴定了125种病毒基因组,其中39种可推定为新的病毒种,丰富了养殖哺乳动物携带病毒的种类。使用生态学地理分布、进化动力学、公共大数据等多学科交叉方法,团队遴选出诺如病毒、盖塔病毒等多种频繁发生“宿主跳跃”的潜在“风险”病毒,解析其跨物种传播规律,并从空间聚类、动物类群、种群、组织等多维度揭示了潜在“风险”病毒的生态学与流行病学特征。

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公开资料显示,黄江,女,汉族,1971年4月生,广西桂林人,1993年5月加入中国共产党,1997年7月参加工作,广西师范大学外语系英美文学专业毕业,研究生学历,文学硕士。

优客网官网登录入口9月4日,广西壮族自治区委组织部发布领导干部任职前公示:现任自治区党委委员,防城港市委副书记、市人民政府市长,广西东兴国家重点开发开放试验区党工委书记(兼)、管理委员会主任(兼)黄江拟进一步使用任设区市正厅级领导职务。

2017年2月,黄江调赴北海工作,历任副市长、市委宣传部部长,市委常委、宣传部部长、副市长等职,后于2020年2月起担任北海市委常委、常务副市长。

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优客网官网登录入口他曾任合肥经济技术开发区经贸发展局局长,肥西县委常委、桃花工业园管委会主任,合肥市对外贸易经济合作局局长,合肥市庐阳区区长、区委书记,庐江县委书记,铜陵市委常委、组织部部长、统战部部长,马鞍山市委常委、常务副市长、市委副书记等职。

FAQ

9月3日上午,澎湃新闻记者先后前往杭州地铁万安桥站和城站站实地探访,了解寄存柜的使用情况。万安桥站是杭州地铁2号线和5号线的换乘站,周边一公里以内有两个省级三甲医院和一家市级医院。记者发现,该站的寄存柜位于车站的付费区,有5个大柜、1个中柜和3个小柜共计9个柜口。柜上的信息显示,大柜和中柜分别能存下28英寸和21英寸的行李箱,小柜能寄存小型包袋。当日9时许,大柜全部空着,而中柜和小柜全部被存满。

城站站是杭州城站火车站所在地,3日10时许,该站的寄存柜规格和数量与万安桥站一样。半个小时内,有两人先后到这里寄存行李,因柜子已被全部存满而离开。其间,一位刘姓大妈还到此处了解寄存柜的使用方法。她说自己是杭州本地人,用过这种柜子,那是在北京旅游的最后一天,酒店退了房,想去景点再逛逛,但又嫌行李带着麻烦,就通过手机找到了这种行李寄存柜。现在她听说杭州地铁开始试点寄存柜,就顺道来看看。“寄存柜对本地人来说作用不大,但是对于游客还是挺方便的,收费可以理解,能提高柜子的使用效率,大柜以后要收费5元/小时能接受。”

澎湃新闻注意到,北京、上海、深圳等地今年已相继在地铁站设立寄存柜,便于市民和游客寄存行李。对此,浙江工业大学公共管理学院教授吴伟强表示,储物是老百姓出行时基础的需求,行李寄存点作为一项基础设施,不仅应该出现在地铁站,超市、火车站等交通枢纽也应配备。

据介绍,试点期结束后,杭州地铁站的寄存柜将按照首半小时免费,第31分钟起开始计费。小柜、中柜和大柜分别按每小时收费2元、4元和5元的标准收费,每24小时封顶收费分别为12元、24和30元。乘客可通过微信、支付宝扫码等方式获取小程序,按照指引自助存取行李,但需在当日地铁运营时间结束即22:30前取件。

据北京日报报道,今年暑运到来之际,北京地铁在南锣鼓巷、奥林匹克公园、珠市口等景区、商业区周边的18座车站增设25处寄存柜,方便来京游客解放双手,轻松出行。此前,北京地铁在1号线军事博物馆、10号线丰台站、7号线欢乐谷景区、亦庄线宋家庄、房山线苏庄5座车站引入共享寄存柜,已累计服务乘客8800余人次。据深圳地铁微信公众号8月12日消息,深圳地铁在皇岗口岸站、福田口岸站、国展站设立了个人存包柜,无论是上下班通勤的商务人士,还是周末出游的休闲一族,都可以将行李暂时存放在个人存包柜中,搭乘地铁,轻装上阵。

据介绍,杭州此次试点行李自助寄存服务是该市推进“轻松游”行李服务一件事改革中的一部分,此前,杭州首推行李“送件进站”,旅客到杭后,在交通枢纽寄存、托运行李,便可一身轻松地去游玩、办事,行李则会被送到酒店;离杭时,可在酒店办理行李托运,再去交通枢纽和行李会合。

“行李寄存点应该是一座城市的标配,应该出现在城市的每个角落,方便大家储物。”浙江工业大学公共管理学院教授吴伟强向澎湃新闻表示,媒体报道称地铁站提供行李寄存服务很超前,这其实是城市科学化管理的一步,即规范化管理,这同公厕一样属于公共基础设施,现在是“补缺”的过程,应该普及。

澎湃新闻记者扫描地铁站寄存柜上小程序的二维码发现,除了地铁站,该小程序还推荐了杭州其他数十个行李寄存点,集中分布在西湖区地铁站点沿线,寄存点的地址包括便利店、茶叶店、商场等地。小程序页面显示,背包寄存价格10元/天,行李箱寄存20元/天,营业时间各不相同。通过小程序,记者搜索到杭州火车站地面一层的寄存点,并通过现场走访发现,那里有不少私人开设的行李寄存处,这里不仅可以通过小程序存行李,还可以同老板私下交易,价格能比小程序上更便宜,行李箱只要15元/天,还有些存放点甚至只要10元/天,并且24小时营业,随时可存取。

9月3日,杭州地铁相关工作人员告诉澎湃新闻(www.thepaper.cn),目前在4个地铁站试点行李自助寄存服务,分别为市民中心站、城站站、万安桥站及吴山广场站,这4个站点的周边有景区、交通枢纽等客流量大的场所。试点时间为8月31日至9月30日,试点期间暂不收费,提供单次8小时行李免费寄存服务。

优客网官网登录入口带着行李辗转于交通站点、酒店和景点,“负重旅游”是影响旅游体验的槽点。继首推行李“送件进站”之后,杭州近日又在地铁设立寄存柜,试点行李自助寄存服务,为游客的旅途“减负”。

澎湃新闻注意到,除杭州外,全国多地已试点在地铁站设立寄存柜,推出行李寄存服务。9月1日起,上海地铁行李自助寄存按计划开始收费,收费标准和杭州一样。在人民广场地铁站,半小时内,不断有乘客前往寄存点存取行李,流转率很高,需求量很大。上海地铁表示,从9月1日起,寄存柜启动收费服务的同时,上海地铁行李寄存柜规模进一步扩大,由332个柜子扩展至736个柜子,增幅超过120%。

3日上午,澎湃新闻记者走进一家私人寄存点,里面摆放着几个铁架,屋内的铁架和地上放着一些行李箱和背包。不一会儿,一位大哥提着背包来此寄存。他说自己姓范,帮人把车从山东开到杭州,准备在杭州火车站坐车返回,不过想在回家前再逛逛,就把行李存在了车站私人运营的行李寄存处。他告诉澎湃新闻,自己经常到各地奔波,有存放行李的需求,按目前地铁寄存柜的收费标准,他觉得价格贵了点。“我还是会选择存到私人存放点,存个小包两天才20元,只要包里没什么贵重的物品,不用担心。”

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