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孩子们被禁止说英语以外的任何语言。他们被迫放弃自己的习俗，穿上西式服装，有些还穿着军装，并皈依基督教。不管他们身上有没有虱子，一到学校就被喷洒农药。来自同一部落甚至同一家庭的孩子常常被分开，以切断家庭纽带。学生名单上将孩子们的"印第安血统"标注为半或一，即一半或全部。

印第安人事务专员在1886年的一份年度报告中也得出了类似的结论："只有将印第安儿童与他的野蛮祖先完全分离，才能使他受到令人满意的教育"。

1879年，第一所位于保留地外的美国政府开办的寄宿学校卡莱尔印第安人工业学校开学了。该校由美国陆军中校理查德·亨利·普拉特创办，他是一名内战老兵，曾在西部边境与原住民作战。卡莱尔的第一批学生中包括美洲原住民战俘的子女。

学校和政府官员将美国原住民的长发视为野蛮的标志，并将其剪掉，这对从小认为自己的头发是骄傲和文化认同的源泉的孩子们造成了创伤。印第安人事务专员威廉·A·琼斯在1902年的一封信中写道，"男性留短发将是向前迈出的一大步，必将加速他们走向文明"。他警告说，如果年轻人从学校回来后不留短发，地方官员就会给他们带来惩罚。在他们遵守规定之前，应该取消他们的工作、供给等，如果他们在这件事上顽固不化，就应该在看守所里短期禁闭，做苦工，剃光头发，以达到治本的目的。

官方网站首页文章称，随着美国原住民被迫离开他们的土地，进入保留地，政府为他们的孩子建立了日校。但美国领导人认为，要彻底根除印第安人的文化，他们需要采取更积极的行动。